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刘君


 



姓  名:刘君      性 别:男   
职  称:研究员
联系电话:010- 82105861      
电子邮箱:liujun@caas.cn      
个人网页:
课 题 组:作物生物信息学
 

本人简历:
    2002获东北农业大学农学士学位,2005年获东北农业大学农学硕士学位,2009年获中国科学院遗传与发育生物学研究所理学博士学位。2009-2014年在美国洛克菲勒大学做博士后、研究助理。2015年至今中国农科院“青年英才A类计划”引进人才。
研究方向:
    主要从事生物学信息和作物功能基因组学方面的研究工作。目前开展课题的主要方向是开发计算生物学分析工具结合多种类型转录组学与表观遗传学检测技术,在小麦种质资源中鉴定穗发育、抗旱、抗逆、抗病等重要农艺性状的调控基因,并论证其生物学功能和调控机理。同时为水稻、小麦、玉米、大豆等主要农作物建立和维护生物学信息技术分析平台和在线基因组学数据共享数据库。
主要贡献:
    在The Plant Cell,The Plant Journal等刊物上上发表论文17篇,其中第一或通讯作者文章5篇。近5年内发表文章被他人引用次数235次。
在研科研项目:
1.中国农业科学院青年英才A类启动经费(主持人)
2.中国农业科学院科技创新工程作物基因组选择育种团队(骨干)
3.人社部回国留学人员择优资助(主持人)
4.中国农业科学院2016年科技创新工程人才专项(主持人)
主要论文和著作:
2016年
1.J. Liu, S. Deng, H. Wang, J. Ye, H.-W. Wu, H.X. Sun, N.-H. Chua,CURLY LEAF Regulates Gene Sets Coordinating Seed Size and Lipid Biosynthesis in Arabidopsis,Plant Physiology, 2016, 171(1): 424-436.
2.P.-J. Chung, B.-S. Park, H. Wang, J. Liu, I.-C. Jang,N.-H. Chua Light-Inducible MiR163 Targets PXMT1 Transcripts to Promote Seed Germination and Primary Root Elongation in Arabidopsis.,Plant Physiology,2016,170(3):1772-1782.
2015年
3.J. Liu ,H. Wang ,N. H. Chua ,Long noncoding RNA transcriptome of plants,Plant biotechnology journal,2015,13(3):319-28.
4.H. Wang, Q.W. Niu, H.W. Wu, J. Ye, N. Yu, J. Liu, N.H. Chua,Analysis of non-coding transcriptome in rice and maize uncovers roles of conserved lncRNAs associated with agriculture traits.,The Plant Journal,2015,84(2):404-416.
5.S. Deng, J. Xu, S.H. Kim, S. Shi, J. Liu, N.H. Chua, JMJ24 binds to RDR2 and is required for the basal level transcription of silenced loci in Arabidopsis, The Plant Journal,2015,83(5):770-782.
6.RNAcentral Consortium,RNAcentral: an international database of ncRNA sequences,Nucleic Acids Research,2015,43:D123-9.
2014年
7.H. Wang,P.J. Chung,J. Liu,I.C. Jang,M.J. Kean,J. Xu,N.H. Chua,Genome-wide identification of long noncoding natural antisense transcripts and their responses to light in Arabidopsis,Genome research,2014,24(3):444-53.
8.J. Jin,D. Panicker,Q. Wang,M.J. Kim,J. Liu,J.L. Yin,L. Wong,I.C. Jang,N.H. Chua,R. Sarojam,Next generation sequencing unravels the biosynthetic ability of Spearmint (Mentha spicata) peltate glandular trichomes through comparative transcriptomics,BMC Plant Biology,2014,14:292.
2013年
9.J. Jin,J. Liu,H. Wang,L. Wong,N. H. Chua,PLncDB: plant long non-coding RNA database,Bioinformatics,2013,29(8):1068-71。
2012年
10.J. Liu,C. Jung ,J. Xu ,H. Wang,S. Deng,L. Bernad,C. Arenas-Huertero,N. H. Chua,Genome-wide analysis uncovers regulation of long intergenic noncoding RNAs in Arabidopsis,The Plant Cell,2012,24(11):4333-45。
11.J. Woo,C.R. MacPherson,J. Liu,H. Wang,T. Kiba,M.A. Hannah,X.J. Wang,V.B. Bajic,N.H. Chua,The response and recovery of the Arabidopsis thaliana transcriptome to phosphate starvation,BMC Plant Biology,2012,12:62.
12.N. Kinoshita,H. Wang,H. Kasahara,J. Liu,C. Macpherson,Y. Machida,Y. Kamiya,M.A. Hannah,N.H. Chua,IAA-Ala Resistant3, an evolutionarily conserved target of miR167, mediates Arabidopsis root architecture changes during high osmotic stress,The Plant Cell,2012,24(9):3590-602。



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