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育种芯片评述性论文在Molecular Plant发表

   来源:ICS 发布时间:2017年8月9日 作者点击数

近日,中国农业科学院作物科学研究所小麦亲本创制和新品种选育创新团队等完成的评述性论文“作物育种芯片与基因型鉴定平台:进展、挑战与展望”(Crop breeding chips and genotyping platforms: progress, challenges and perspectives)在分子植物(Molecular Plant,IF=8.827)期刊在线发表,合作单位包括国际玉米小麦改良中心、康奈尔大学和国际半干旱热带地区作物研究所。该文对作物分子标记发展概况、分子育种进展、基因型与表型关系、现有高通量基因型检测平台利弊、育种芯片的高通量与灵活性等方面进行了系统评述分析,认为随着基因组学技术的发展,分子标记在作物遗传育种领域应用将更加广泛。目前在25种作物中已开发出50多种SNP芯片及15种基于测序技术的基因型检测平台,但真正符合育种家需要的并不多,为此提出了发展高通量、低成本兼具灵活性的实用分子育种平台策略,将极大提高育种效率,加速培育适应全球气候变化的作物新品种。

SNP芯片已成为作物遗传改良的重要工具。该团队在前期成功开发小麦KASP基因型检测平台的基础上,与公司合作研制出新型50K小麦育种芯片,概括起来有四大优点:(1)标记多态性高、应用范围广,适用于不同遗传背景的小麦材料检测;(2)标记分布均匀,每条染色体含2000多个SNP标记;(3)含功能基因及与性状连锁标记,包括135个品质、农艺性状和抗病性等基因标记及与重要性状紧密连锁的700个标记,这是其它芯片不具备的;(4)比同类芯片价格低20%。该芯片既可用于以研究为目的的遗传多样性分析与新基因发掘,也可用于新品种选育中的亲本分子鉴定与高代品系基因确认等,具有自主知识产权。目前中国科学院遗传发育研究所、中国农业科学院作物科学研究所、山东省农业科学院、西北农林科技大学等10余家单位已定制6000余份。本研究得到国家重点研发计划专项(2016YFD0101802、2016YFE0108600)、国家自然科学基金(31550110212)和中国农业科学院创新工程的资助。

   全文链接地址:http://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(17)30174-0

  




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